Hola:
Si realmente te interesa usar JQuery, danos un aviso para mover el tema al foro adecuado, pero en principio, para pensar en píxeles suelos, debemos usar capas de 1x1 posicionadas, y lo de cambiar el color, pues con javascript normal y un temporizador podría bastarte... Te paso un ejemplo de pixelado:
Pixelator
Saludos
