Bienvenido.
 
Podrían ser mil cosas. El modelo de color, efectos, perfiles, calibración del equipo. "Perfecto" es muy relativo, tanto que "perfecto" debería ser igualito a la impresión final. 
Unos enlaces de orientación. Están un poco incompletos aún, pero de algo servirán. 
http://www.otake.com.mx/Apuntes/Colo...ibration.phtml http://otake.com.mx/Apuntes/RGB-CMYK/  
Como dice Sergio expórtalo.
Una duda. ¿en realidad se sigue usando el eps? No sé porqué no se usa universalmente el pdf, pero en fin.