FTP siginifica "File Transfer Protocol" y es unicamente sirve para enviar/recibir archivos, si dices que tu servidor no lo acepta pues.... simplemente no podrás subir nada, ni html, ni imagenes, ni css, ni flash, ni nada, a menos que el servicio te proporcione un formulario para subir archivos.
Estubo bueno eso de "es un archivo flash (no hecho en flash)"
saludos