en primer lugar debes recordar que # es un identificador "único", tal vez ie, no lo tome tan a la ligera como firefox (y creo que esta hace lo correcto)...
puedes usar el siguiente selector: input:checkbox e input:checked
Código HTML:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<script language="javascript" type="text/javascript" src="extras/js/jquery/jquery-1.3.2.min.js"></script>
<script language="javascript" type="text/javascript">
$(document).ready(function(){
$("#btn_todo").click(function(){
$("#frm_persona input:checkbox").each(function(){
tr_ide = $(this).parents("tr").attr("id");
ide = tr_ide.replace("tr_ide_", "")
alert("Ide de persona: " + ide);
});
});
$("#btn_seleccionado").click(function(){
$("#frm_persona input:checked").each(function(){
tr_ide = $(this).parents("tr").attr("id");
ide = tr_ide.replace("tr_ide_", "")
alert("Ide de persona: " + ide);
});
});
});
</script>
</head>
<body>
<form id="frm_persona">
<table>
<tbody>
<tr id="tr_ide_1">
<td><input type="checkbox" /></td>
<td>hector2c</td>
</tr>
<tr id="tr_ide_2">
<td><input type="checkbox" /></td>
<td>conejo</td>
</tr>
<tr id="tr_ide_3">
<td><input type="checkbox" /></td>
<td>edward</td>
</tr>
<tr id="tr_ide_4">
<td><input type="checkbox" /></td>
<td>gissella</td>
</tr>
</tbody>
<tfoot>
<tr>
<td colspan="2">
<input type="button" id="btn_todo" value="Todos" />
<input type="button" id="btn_seleccionado" value="Seleccionados" />
</td>
</tr>
</tfoot>
</table>
</form>
</body>
</html>