Según entiendo ¿tu problema es pasar una variable de un popup a una ventana padre?
Si es así, es más tema de JavaScript que de ASP.
Se me ocurre que podrías tener un input hidden o algún elemento HTML similar en la ventana padre, de manera que al hacer click en el link de la ventana hija asignaras un valor a dicho input:
Código:
<script>
opener.document.getElementById("inputHidden").value = "un valor";
</script>
Algo así, saludos.