En ese caso todos los texto que esten vacios puedes usar una condición para que los elimine, por ejemplo
Código PHP:
Ver originalforeach($_POST["marca"] as $v){
$marca[] = $v;
}
for($i=0; $i<count($_POST["check"]); $i++){ echo $_POST["check"][$i] . " - " . $marca[$i] . "<br />";
}