Prueba con algo asi:
Código PHP:
<?php
$sql="select * from tabla";
$rs=mysql_query($sql);
if(!mysql_error())
{
//cantidad de registros a mostrar por tabla
$cantidad=100;
//cuento los registros totales de la tabla
$numregs=mysql_num_rows($rs);
//numero de tablas a mostrar
$tablas=$numregs/$cantidad;
for ($i=0;$i<$tablas;$i++)
{
$inicio=$cantidad*$i;
//extraigo de la tabla 100 registros y los muestro en el while creando el codigo de la tabla
$sql="select * from tabla limit $inicio,$cantidad";
$rs=mysql_query($sql);
if(!mysql_error() && mysql_num_rows($rs)>0)
{
?>
<table>
<?php
while($datos=mysql_fetch_assoc($rs))
{
?>
<tr>
<td><?php echo $datos['campo1'];?></th>
<td><?php echo $datos['campo2'];?></th>
<td><?php echo $datos['campo3'];?></th>
</tr>
<?php
}
?>
</table>
<?php
}
}
}
?>