Cuando digo directorios que "gestionen bien las webs" me refiero a directorios que tengan un criterio de calidad para la inclusión de un sitio web.
Como bien dices no aparecen para nada en las SERPs, pero un enlace en algun blog (por ejemplo) pienso que tampoco apararecerá, pero si añade valor a tu web de cara a los buscadores al ser un enlace (supuestamente) de calidad.
Además, si Google solo tiene en cuenta un 5 % de las webs que añadiste, quiere decir que ese 5% de directorios es de calidad o al menos eso parece. Hay que mandar las webs a directorios que merezcan la pena, y eso creo que en un día o dos lo tienes listo. Tampoco hay que abusar de envio de webs.
Siempre hablo desde mi experiencia propia ¿eh?
¡Saludos!
PD: Si tienes tiempo, ¿podrías decirnos que directorios han sido considerados por Google de los que comentas?.