nunca he visto que css interprete codigo javascript. ¿fue algo que te inventastes o lo viste en algun lugar? en todo caso estoy seguro que no se puede hacer. las alternativas que conozco son con javascript o lenguaje servidor. en javascript, seria cuestion de leer la cookie y asignarle un estilo inline al documento.
Código:
document.body.style.backgroundColor = // aqui invocas GetCookie;
en lenguaje servidor seria cuestion de leer la cookie y asignar el valor en un style o algun otro lugar. por ejemplo, en php no estoy seguro si se hace asi,
Código:
<style type='text/css'>
background-color: <?php echo $_COOKIES['nombre de cookie']; ?>
</style>
o podria ser una hoja de estilo pero habria que configurar el servidor para que php analice las hojas de estilo.