La respuesta puede ser crear escenas en WRML. Distintos programas permiten exportar la escena generada en 3D y transformarla a este formato...
 
Para poder incorporarlo a la web se necesita un visor de WRML, uno de ellos es el COSMO, se puede encontrar por ejemplo en esta dirección 
http://foro.gabrielortiz.com/index.asp?Topic_ID=11740 
En esta otra dirección hay una relación de visores WRML y las características de cada uno de ellos... 
Espero os sean de ayuda