Si te entendí bien podrías codificar los datos para luego, en php, usar json_decode.
La idea sería hacer algo como esto:
Código PHP:
<script>
var datos_refer = new Array();
datos_refer['conta'] = 'ssss';
datos_refer['id'] = 5;
datos_refer['cantidad'] = 15;
datos_refer['descuento'] = 20;
datos_refer['adicional'] = 'bla';
var cad='{';
for(var i in datos_refer){
cad+='"'+i+'":"'+datos_refer[i]+'",';
}
var cad =cad.substring(0,cad.length-1)+'}';
alert(cad);
</script>