bueno. en este caso primero creas un archivo que haga el bucle de los checkbox y otro archivo procesar.php.
alli colocas el codigo que hara el insert con el bucle for.
Código PHP:
Ver originalfor ($a = 0; $a < $_POST['chk']; $a++ ){ #inicia el bucle.
$asistencia = $_POST["asistencia"][$a];
$sql_asistencia_alumnos = "insert into asistencia_alumnos(asistencia)";
$sql_asistencia_alumnos .= "values('$asistencia')";
} # termina el bucle for.
saludos.