No confundas la versión del phpMyAdmin (2.11.2, la que tienes disponible), con la del MySQL (5.0).
En cualquier caso la cosa puede ser problemas de bugs de MySQL o de phpMyadmin, porque en ambos casos son versiones viejas. El phpMyAdmin ya va por la versión 3.2 y el MySQL la 5.4.
Yo pensaría en un problema combinado entre ambos...
Prueba ejecutar esto:
Veamos si la cosa funciona así...