¿y cual es el problema? creo que esta bien escrito. tambien puedes intentarlo asi,
Código:
<script type="text/javascript">
var counter = <?php echo $totalRows_recorset2; ?>;
</script>
adicional, pero absolutamente nada relevante a tu caso. por el amor de los apasionados con el lenguaje. por favor, no es java. java es otra cosa.