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Iniciado por AdrianSeg 
A mi me paso lo mismo con los estilos, lo solucione copuiando el archivo de estilos en la carpeta donde lo busca, fue una solucion cutre pero efectiva, debe haber alguna menera usando la variable path de php o algo porque menudo follon el d los includes cuando trbajas con subcarpetas...no le hace caso ni a las rutas absolutas ni relativas...almenos fue mi caso.
Lo único que tienes que hacer es saber moverte por directorios sin ratón, como se hizo toda la vida. Conoces el comando cd? Pues de la misma forma:
./ mismo directorio
../ directorio anterior
/ directorio raíz
../../dos directorios antes...
etc