Podrias ir como primer paso a
Archivo/Configuracion de publicacion File > Publish Settings
Seleccionas como archivo de salida Flash y HTML
vas a la pestañita de HTML, y verificas la opcion
MODO DE VENTANA, que sea
Transparente sin ventanas WMODE>> Transparent
y le das publicar, y veras el codigo fuente del HTML..
Tambien puede modificarlo de manera manual.. lo importante es esta secciones que te marco
Cita: <noscript>
<object
classid="clsid:d27cdb6e-ae6d-11cf-96b8-444553540000"
codebase="http://download.macromedia.com/pub/shockwave/cabs/flash/swflash.cab#version=8,0,0,0"
width="840"
height="230"
id="mi-pagina-flash"
align="middle">
<param name="allowScriptAccess" value="sameDomain" />
<param name="allowFullScreen" value="false" />
<param name="movie" value="oscurecer-pagina-con-thickbox-y-lightwindow.swf" />
<param name="quality" value="high" />
<param name="wmode" value="transparent" />
<param name="bgcolor" value="#000000" />
<embed src="el-archivo-flash.swf" quality="high"
wmode="transparent" bgcolor="#000000" width="840" height="230" name="mi-pagina-flash" align="middle" allowScriptAccess="sameDomain" allowFullScreen="false" type="application/x-shockwave-flash" pluginspage="http://www.macromedia.com/go/getflashplayer" />
</object>
</noscript>
espero te sirva... esta probado en Firefox