Si es posible, pero creo que seria mas eficiente cambiar el sistema de comentarios para usar base de datos, realmente no es tan complicado.
Para seguir manejandolo con archivos de texto, solo tendrias que modificar el script, de manera que al leer o agregar comentarios abra un archivo especifico; por ejemplo, en el enlace que colocas, la ID de noticia es 6, el nombre de archivo para comentarios podria ser:
comentarios_6.txt y, para usarlo en el script, algo como:
Código PHP:
Ver original$noticia = $_GET['not_ID'];
$archivo = 'comentarios_' . $noticia . '.txt';