Si tenes un div identificado, y queres actualizar sus contenidos, podes hacer esto:
<div id="target">
... contenidos ...
</div>
$("#target").html("<p>Nuevos contenidos que reemplazan a los anteriores</p>");
De similar manera, pero usando ajax, podrías hacer:
$("#target").load("url.php");
Y vas a tener tu php sobreescribiendo el contenido original.
nota: si no lo quisieras sobreescribir, usarías metodos como .append()