he estado investigando y si se puede hacer SEO en paginas totalmente echas en Flex que finalmente generan un SWf, inclusive quedan en mejor posicionaminto que las echas con html, php, similares.. el detalle es que se hace de manera diferente sin embargo a la larga resulta mas facil hacerlo ya que te genera una web 100% optima la cual puede contener por ejemplo la vista para html, la vista Flash, y tambien para celulares todas ellas ayudando en el posicionamiento, hay herramientas que te permiten tener el contenido en una capa y el diseño en otra lo que permite indexar tus paginas en google por ejemplo, este es un tema muy interezante y muy extenso el cual voy a tratar de la mano del proyecto aprendiendoFlex y para ello y en su primera version tenemos:
http://detodoconroberts.blogspot.com/
les agradesco sus comentarios y esperaria me dieran consejos y sugerencias sobre SEO y yo me encargo de la manera de utilizarlo con Flex
en cuanto a las paginas echas totalmente en Flex tenemos:
http://www.codeoscopic.com/ por citar un ejemplo..
si gustan pueden contactarme en twitter
@FlexJRL