Hola:
Un popup reconoce la página o ventana que lo ha abierto como el objeto opener. Como se trata de un objeto de tipo window (ventana), debe seguir de document y luego la referencia del control donde quieres volcar el dato... o sea:
opener.document.forms.el_form_que_sea.el_control_q ue_sea.value = lo_que_sea;
window.close();
Saludos