Cita:
Iniciado por abimaelrc 
Para ello te sugiero usar direcciones absolutas, puedes usar la variable $_SERVER["DOCUMENT_ROOT"].
Código PHP:
Ver originalinclude($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] . "/archivo.php");
Entonces, los enlaces quedarian así?
<a href="<include($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] . "/archivo1.php");">Archivo 1</a>
<a href="<include($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"] . "/archivo4.php");">Archivo 4</a>