El contenido de los divs laterales son modulos, en EXTENSIONES luego GESTOR DE MODULOS puedes decidir cuando deben o no aparecer. Te coloco un ejemplo para validar que un div solo se muestre cuando dicho modulo este activar.
Código PHP:
<?php if($this->countModules('user2')) : ?>
<div id="nubetags"><jdoc:include type="modules" name="user2"/></div> <?php endif;?>
El anterior codigo lo que hace es validar que solo se muestre el div con el modulo cuando dicho modulo este activado.