Wamserver no es un equivalente a SQL Server. Es solamente un paquete de instalación de Apache+PHP+MySQL.
Lo que tu estás buscando es en realidad lo que se denomina
CASE Tools, es decir, herramientas de diseño asistido, en tu caso orientado a las bases de datos.
Hay muchas herramientas de ese tipo, tales como
ERWin, Navicat, SPARX Enterprise Architect, etc. MySQL incluso tiene la suya propia, que es MySQL Workbench y que puedes descargar de la página oficial:
Download MySQL Workbench