Puedes colocarlo tanto en 
pre_main_global.conf como en 
pre_virtualhost_1.conf, agrega:  
 Cita:  ServerLimit 500
MaxClients 500
    También puedes hacerlo por 
WHM - Apache Configuration - Include Editor. 
Reinicia servicio, y luego corre el distiller para fijar los cambios, eso debería bastar. 
Saludos,