Está claro que un sistema que recoge las estadísticas desde el servidor va a dar más visitas que uno que lo haga desde el navegador del usuario.
Puede haber varios motivos:
- La petición puede interrumpirse voluntaria o accidentalmente. Puedes empezar a cargar una página (el servidor cuenta la visita) pero cancelarla antes de que haya terminado (Google Analytics aún no se ha cargado).
- También influye si el código de Analytics está bajo <body> o justamente antes de </body>, cuanto más abajo esté, menos visitas dará (a largo plazo y con muchas visitas, se entiende).
- Es posible desactivar la visibilidad de un navegador ante Google Analytics. Basta con instalar una extensión para Firefox o bloquear las peticiones al servidor de Analytics a través del archivo hosts del sistema operativo.
Como bien te dicen, las estadísticas siempre son aproximadas.