Hola Marin3h, bienvenido al foro.
En cuanto a tu pregunta.
Si usas Photoshop, te lo recomiendo para hacer páginas web.
Piensa que tu archivo en capas lo va tener que interpretar quién vaya a maquetarlo asi que sé claro en los nombre de capas, grupos, orden. Para explicar cuestiones precisas (sobre si cambia el color de BG, o variables a menudo uso notas sobre el archivo. son super prácticas.
te dejo un artículo (en inglés) muy bueno sobre lo que hablo.
saludos