Habría que ver como propagas el SID si manual o automatico y si a su vez lo haces en una cookie ..
Si lo haces manual y en una cookie (lo típico) .. el SID que se progaga en la cookie .. dicha cookie solo tiene validez en el ambito del domino/subdomino que se creó ..
Si trabajas con subdominos vas a tener que propagar el SID en modo manual (a mano en tu programación) y NO usar propagación en cookie del SID..
Mas info:
http://www.php.net/manual/en/ref.session.php
Un saludo,