y no leiste los manuales, a veces hay cosas interesantes ;)
$this->db->select();
http://codeigniter.com/user_guide/da...ve_record.html
Por cierto deberías repasar o leer un poco de MVC.
Saludos.
PD: Por cierto nada te impide hacer el query directamente. Soy de la filosofía "No te ates a las reglas" :D