VirtualDubMod y archivos mp4

[redbix]

Hola compañeros:
He descargado una película en mp4, con muy buena calidad. Al querer pegarle los subtítulos con VirtualDubMod, como hago habitualmente para obtener un DVD compatible con cualquier reproductor, el VirtualDubMod no reconoce el formato mp4. He intentado otras cosas, como convertir primeramente a avi, pero sin resultado satisfactorio.
Hay algún otro programa que permita incrustar subtítulos a archivos mp4?
Gracias por vuestra atención.