imagemagick es un programa que se ejecuta desde línea de comandos, si lo haces desde el cmd de windows (INICIO>EJECUTAR) o desde el shell de linux sería:
/ruta/a/imagemagick/composite -gravity Center /ruta/a/tu/caratula.png /ruta/atu/archivosubido.jpg[600x800] -density 72 -quality 90 /ruta/a/carpeta/destino.jpg
desde php:
Código PHP:
Ver originalsystem('/ruta/a/imagemagick/composite -gravity Center /ruta/a/tu/caratula.png /ruta/atu/archivosubido.jpg[600x800] -density 72 -quality 90 /ruta/a/carpeta/destino.jpg');
800x600 es el tamaño que tenga tu imagen de caratula, que también supongo que está en formato PNG