Luego de instalar XP, otro XP dejó de funcionar

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¿Cómo arrancabas cada sistema, modificando el orden de inicio de los dispositivos? Es decir, dos sistemas operativos totalmente independientes que funcionan incluso si desconectas el otro disco, o está de otro modo...

Desde el sistema operativo del disco B puedes ver el contenido del disco duro A. Puedes revisar el archivo de sistema oculto boot.ini de ambos discos. Para más información sobre estos archivos puedes realizar una búsqueda en el foro u otros buscadores.