subiendo imagenes

[marcos46g]

Hola aca estoy intentando resolver un pequeño problemita.
Mediante un formulario con method="Post" enctype="multipart/form-data" el usuario puede subir imagenes al servidor.
Solo le permito subir imagens jpg, png y gif .
Cuando estas imagenes se guardan en el servidor no comprendo porque cambian de formato y se guardan en un formato que solo se puede abrir en un broswer y dejan de ser jpg o la que corresponda-.
Hasta ahora nunca me habia preocupado esto , pero ahora estoy intentando agregarles una marca de agua.
Ya he logrado tener un código que imprime marcas de agua pero en imagenes jpg, png y gif .
Pero no encuentro soporte para el formato en el que quedan en el servidor .
Mi pregunta es aparte de ImageCreateFromGif,ImageCreateFromPNG y ImageCreateFromJPEG Hay algo para ese formato en que se guarda en el servidor?
Tambien se me ocurre que tal vez podria pegarle la marca de agua cuando aun esta en la carpeta temporal que ahi me parece qiue aun tiene el formato original en que se sube. Es esto posible ?
Tampoco se si esto sucede en todos los hosting pues en este momento esty en uno gratuito
Cualquier sugerencia la valoraré muchisimo!!!
Gracias desde ya