Ayuda con Acronis

[MORKAS]

Saludos compañeros, aprovecho para presentarme, no encontre donde hacerlo...tengo dudas con este programa de creacion de copias de seguridad, vereis,en un disco duro de 500 gigas, he creado 2 particiones, una para el sistema y otra para los datos, hasta ahi bien. Despues de instalar el sistema y los programas,creo con el acronis una particion llamada Secure Zone, en la cual creo la copia de seguridad de la unidad o particion C, en la cual esta el sistema, que es lo que me interesa restaurar con el tiempo, a fin de evitarme el jaleo de instalar y instalar programa tras programa. Al parecer no hay ningun problema con la creacion.
Ahora pregunto, si por ejemplo elimino toda particion del ordenador (previamente guardando el archivo de copia de seguridad en otro disco externo, u otro disco duro interno diferente), y deseo recuperar esa copia, desde un disco de inicio de acronis, puede darme algun tipo de error al arrancar windows despues de restaurar la copia?, vereis os explico lo que me ha sucedido , he hecho lo anterior, sin destruir las particiones, pero al restaurar la copia de seguridad y arrancar el pc, me da el error de disco de sitema, o falta bootmgr.
Preguntas:
.¿Cual seria la mejor forma de usar este programa?, crear la copia de seguridad en la particion que no contenga el sistema operativo?, aun siendo el mismo disco duro fisicamente?, y restaurala desde el disco de inicio de acronis, en lugar de pulsar la tecla f11 y seguir el proceso del asistente?

.¿Porque al visionar la copia de seguridad hehca en el acronis, aparecen 2 particiones o copias?, me refiero a que la copia de seguridad consta de :
1. la copia del sistema C
2.Una pequeña particion o disco llamada MBR
es que he de restaurar las 2? para que arranque el sistema?......

uffff, no se si me he explicado, pero espero que alguien que use este programa, me recomiende la mejor forma de utilizarlo, sin tener problemas de que no me arranque el sistema despues de restaurar la copia con Acronis......
muchas gracias....