Mover html

[Panino5001]

En ese caso te tocará trabajar con un player en el que puedas controlar el método seek con javascript, ya que, en caso contrario, como bien dices, empezará de cero al copiarlo en la nueva estructura (sería lo más simple: se me ocurren otras soluciones pero son más complejas y seguramente más costosas desde el punto de vista del rendimiento). Igualmente conviene que preguntes en el foro de jQuery si es tu herramienta base.