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[mberenguerv]

Tu propuesta tiene exactamente el mismo problema que yo quiero solucionar.
En la tabla contrato que propones podría tener una clave ajena apuntando a una empresa y otra clave apuntando a un departamento perteneciente a una empresa distinta de la anterior.

De cualquier forma, gracias por contestar.

¿Es posible que esto no se pueda modelar mediante E-R y simplemente haya que comprobar mediante el código de la aplicación que un empleado no se ascia con un departamento que no es de su empresa?.