Hola,
 
Si, es correcto. Otra forma es usar ' para la cadena total: 
 Código PHP:
    $comando = 'grads -pbc "parametro"';
exec($comando); 
    
  Aunque de esta forma no puedes incluir directamente variables PHP, tendrias que concatenarlas. 
Esto se debe hacer asi (escapando las dobles o usando las simples) porque primero PHP parsea las cadenas y luego se la pasa a la funcion. 
Saludos.