Creo que es un error que te da javascript. Debes indicar quien te da el error, si PHP o javascript. Es debido a que estais poniendo el echo $HTTP_GET_VARs fuera de las comillas de javascript y entonces lo entiende como si seria una variable javascript la cual no esta definida. Deberias poner:
Código PHP:
Abrir_ventana('http://www.dominio.net/archivos/'+'<?
// Reftifica aqui;
echo $HTTP_GET_VARS['archivo'];?>'+'.zip')
//BAJADA AUTOMÁTICA DEL ARCHIVO
nuevaUrl='http://www.domino.net/archivos/'+'<?
// Reftifica aquí;
echo $HTTP_GET_VARS['archivo']; ?>'+'.zip'
nuevaWin='_blank'
Y si te lo curras un poco puedes eliminar esas concatenaciones de javascript.
Suerte.