interpretar javascript desde ajax

[rotivo]

Hola mi problema es uqe no se ejecuta el javascript de las paginas obtenidas mediante la funcion ajax:

function FAjax (url,capa,metodo) {

var ajax=creaAjax();
var capaContenedora = document.getElementById(capa);

ajax.open ('GET', url, true);
ajax.onreadystatechange = function() {
if (ajax.readyState==1) {
capaContenedora.innerHTML="Cargando.......";
}
else if (ajax.readyState==4){
if(ajax.status==200){
document.getElementById(capa).innerHTML=ajax.respo nseText;
}
else if(ajax.status==404)
{

capaContenedora.innerHTML = "La direccion existe";
}
else
{
capaContenedora.innerHTML = "Error: ".ajax.status;
}
}
}
ajax.setRequestHeader('Content-Type','application/x-www-form-urlencoded');
ajax.send(null);
}

tengo que cambiar toda la funcion no? por que con responseText solo obtengo texto plano o hay alguna forma de que me interprete el javascript? Gracias!