Los PDF estan en una ruta accesible para PHP? Si es asi, entonces solamente tendras que especificar la ruta adecuada para cada archivo.
Si no... Los PDF estan accesibles desde internet? Si es asi, entonces puedes usar cURL o similar, siguiendo el aporte que
Abimael hizo en:
http://www.forosdelweb.com/f18/aport...equest-724214/
Si no... tendras que buscar cumplir alguna de las dos opciones anteriores o no lo lograras.