Haz puesto tu código por partes, separado, pero no en su conjunto, así no podremos ver bien que pasa. Sin embargo presumo que en cada bucle imprimes todo el rollo del último código que muestras. En ese caso ese código se repetirá una y otra vez por cada bucle, con lo cual se definirán una y otra vez lo que se ejecutaría cuando el documento haya cargado, con lo cual solo se ejecutaría el último código., por eso solo ves el último valor. Para que veas bien de lo que hablo fijate en el código generado.
Solución? Te lo voy a explicar teóricamente, porque un código para modificarlo y darte la respuesta exacta no tengo. Si pusieras el código completo podría darte una ayuda precisa. Bueno, esta es la sugerencia: Debes poner esto antes del while:
Código:
echo "<script type=\"text/javascript\"> \n";
echo "var chart; \n";
echo "$(document).ready(function() { \n";
Solo hasta ahi, al final del bucle, pues tienes que hacer el cierre:
Justo en el while debes ir imprimiendo las variables para que se ejecute la acción correspondiente con cada uno de los registros obtenidos mediante la consulta. Espero que hayas entendido la idea, sino pues muestranos tu código completo para poder ayudarte más efectivamente. Suerte!