Hola,
Posiblemente,
Código:
if (!is_dir($file) && $file != "." && $file != "..") {
que no sea un directorio y que no sea igual al directorio actual ('.') y que no sea igual al directorio padre ('..').
Y como indica carlos_belisario,
Código:
if ($handle = opendir("./images")) {
aunque no es obligatorio, en PHP es preferible evitar asignaciones en condiciones.
Saludos,