Problemas con archivos en App_code

[milky]

Saludos:

Tengo una problema, resulta que estoy migrando un sitio en aspx con c#, de un servidor a otro, y resulta que todo funciona, menos un opcion de registro de usuario, y sucede que las funciones estan en unas clases que estan C#, se encuentran en carpeta App_Code, y no las toma, yo solo copie el sitio del servidor antiguo y lo pase al nuevo, por lo que mi consulta es, se debe configurar algo, o debo modificar algo en estos archivos, se lo pregunto por que puse banderas de alertas en los archivos y al ejecutar no hace nada.

Ayuda please, yo soy nueva en .Net, por lo que igual pido paciencia.

Muchas gracias desde ya.