Revisa este código, e intenta adaptarlo a lo que necesites, pero mas o menos, es lo que quieres.
Código PHP:
$f=fopen('kramnik.pgn','r');
$act=null;
valores = null;
while(!feof($f)){
$act = fread($f);
$valores[] = $act;
if ($act == '') {
// Aqui hacemos el insert
$q = "INSERT INTO chesstemporal (event, site, game) values ('$valores[0]', '$valores[1]', '$valores[2]')";
mysql_query($q, $link);
$valores = null;
}
}
fclose($f);