Encontré el problema, resulta que en mi localhost no tengo permitido los short tags de php y había un layout que le faltaba el tag PHP, linea 12
Código PHP:
Ver original<html>
<head>
<title>Tu Sitio Modular</title>
<basefont color="#FFFFFF" face="Verdana" />
</head>
<body bgcolor="#9999cc">
<?php include('includes/header.html'); ?>
<table width="100%" border="0" cellspacing="1" cellpadding="1">
<tr>
<td width="140" bgcolor="#5b69a6"> </td>
<td>
<?
if (file_exists( $path_modulo )) include( $path_modulo ); else die('Error al cargar el módulo <b>'.$modulo.'</b>. No existe el archivo <b>'.$conf[$modulo]['archivo'].'</b>'); ?>
</td>
</tr>
</table>
<?php include('includes/footer.html'); ?>
</body>
</html>
Un saludo!