Si es que entendí bien, podrias hacer lo siguiente:
Código PHP:
//Archivo blabla.php
$in_script = true;
include("config.php");
//Archivo config.php
if($in_script){
//Coneccion a la base de datos,etc..
}else{
echo 'Estas intentando entrar a un area restringida';
}
Espero haber sido de ayuda ;)
Suerte!