Cita: Yo tengo separado la parte visual (todo lo que es html) de el codigo php, a excepcion de cuando necesito mostrar informacion donde a fuerza o eso creo, tengo que leer el resultado de la consulta hasta que no haya registros por leer y esto tengo que ponerlo en la pagina con el html ya sea dentro de una tabla o cualquier otro elemento...
Haces bien. Una cosa es tener todo tu código PHP embebido junto a HTML (cosa que sería "incorrecta") y otra cosa es lo que tu haces. Tener en archivos aparte el código PHP y en el HTML tener el código PHP necesario. Así que realmente eso esta bien
Ahora bien, si te interesa tenerlo todo mejor ordenado, con más lógica, etcétera. Podrías hecharle una ojeada al patrón de diseño MVC
