Dudas sobre OsCommerce y SEO

[Leingod]

Buenas tardes. Tengo una duda que necesito resolver para mi trabajo, espero que algún entendido pueda ayudarme.

Mi empresa tiene montada una tienda OsCommerce [la cual estamos en vías de sustituir, pero aun va para rato], y uno de los responsables en temas de SEO soy yo. Tenemos una gran cantidad de categorías en las que no tenemos ningún producto, principalmente porque cuando no son necesarios los desactivamos.

Mi duda es la siguiente: tenemos una gran cantidad de categorías sin ningún producto dentro, ¿esas categorías podrían producir algún tipo de error que me penalizara Google, por ejemplo 404? ¿O incluso pueden ser beneficiosas en busca de futuras posibles búsquedas?

Ya que estamos, pura curiosidad... ¿Qué tipo de cosas pueden provocar una 404 en OsCommerce?

Un saludo, gracias por su tiempo.