Hola,
Mirá, utilizando ...
Te aplica el formato de la fecha. Pero sin tu código no podré darte la solución precisamente. Pero de ésa forma te funciona.
En date("Y-d-m") es el formato que yo utilicé para mostrarte una solución, pero por lo que veo estás tratando de convertirlo a Y-m-d, eso lo hacés a tu gusto.
Busca en el manual de php los formatos que podés utilizar dentro de date.
Saludos.