Al final lo arregle así
Código SQL:
Ver original(SELECT DISTINCT(Tipo) FROM bd1.inmueble
WHERE Estado='1' AND Operacion='Alquiler')
UNION
(SELECT DISTINCT(Tipo) FROM bd2.inmueble
WHERE Estado='1' AND Operacion='Alquiler')
SIn la select de delante y con union. No sabía que el union all y union eran distintos!
Gracias a todos