Saludos
Esto te puede orientar
Código PHP:
$text="Contenido que va estar en el archivo";
$filename = //Ruta del archivo/nombre del archivo
$handle = fopen($filename, "a");
fwrite($handle, $text);
fclose($handle);
Para lo del consecutivo seria uqe lo manejaras en una tabla de tu base de datos y lo estes actualizando cada vez que se guarde el archivo se me ocurriria
Puedes revisar el manual de php
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